Программа рассчитана на два года, в течение которых ребята знакомятся с базовыми основами теории эволюции, палеонтологии, геодезии и других геологических дисциплин, изучают особенности палеоэкологии и палеофаунистики Подмосковья и некоторых других регионов России, обучаются умению вести полевой дневник, писать научные заметки и рефераты, получают практические навыки проведения полевых исследований.

Помимо теоретических занятий члены палеонтологического кружка регулярно совершают однодневные выезды в Подмосковье на геологические разрезы, где можно воочию увидеть и собрать разнообразную ископаемую фауну.

В летние каникулы юные палеонтологи отправляются в более дальние экспедиции для знакомства с ископаемыми других регионов России, откуда привозят не только коллекции образцов, но также видеофильмы и многочисленные фотографии.

Результаты этих поездок находят свое отражение в докладах, которые самостоятельно готовят для школьных конференций участники экспедиций.

Члены палеонтологического кружка, занимающиеся в музее, наряду с другими школьными кружками юных палеонтологов регулярно участвуют в проходящей ежегодно выставке "Удивительное в камне", а многие бывшие его воспитанники выбрали своей профессией геологию или палеонтологию.